【席次】妹を友人卓に入れるのはだめですか？

個人的には妹さんがいても問題ないと思います。

ご親戚には事情を話せば、
厳格な方ではない限り、なんで？と思う人もいないと思いますが
ご友人席は最前列ではなくて家族席寄りにするなど
されてはどうでしょうか？

席次を決める際は、同じテーブルの方がお話しやすいようにすることも
大切だと思いますし、バランスの問題でそのほうがよいのであれば、
友人テーブルに妹さんがいても、何の問題もないと思います。

式場の、担当者の方に相談されたほうがいいと思いますが・・・
そういう例はいくらでもあるとおもいます。

私もみなさんと同じで問題ないと思います。

事前に親戚には人数の関係で、友人たちと妹たちなら年代も近いし、そちらの席にしてもらったとはなしておけば大丈夫だと思います。

私は「妹」として姉の友人テーブルに座りました。
同じテーブルには顔見知りの人も居て一緒に楽しませてもらえましたし
周りからも何も言われていないそうですよ。

親族も「テーブルが増やせなくてね」と伝えていたので
誰も文句を言うような子とはありませんでした。

日頃から口うるさい人が居ないのであればそこまで気にされる必要は無いと思います。
念の為、彼側や親族に一言伝えてみてはいかがでしょうか。