結婚後の働き方についてアドバイスをお願いします

会社がどんなタイミングで直接雇用するかは会社が決めることだと思いますが、今のところ妊娠しているわけではないので直接雇用されて良いと思います。もし直接雇用するとなった時会社から妊娠についての予定などを聞かれたら話せば良いことで会社の判断に従うべきだと思います。妊娠したら産休など取れるのか確認するのも良いと思います。
少々初めての妊娠でフルタイムでの勤務はどうかなと思いますが、完全に働かないというなら身体に負担や不安が無く厳しい家事以外は良いと思います。アルバイトなども生活にプラスになるなら良いと思います。ご自身が今後どんなライフスタイルをしたいのかだと思いますが、仕事に時間を使うか家族に時間を使うか自身の時間が大切かなど考えられると経済状況も踏まえて結婚後の働き方が見えてくるかもしれませんね。
補足になりますが結婚している友人なんかはあらかじめ旦那の転勤があると会社に話しているみたいですよ。それから妊娠しながら働くということはある程度会社の周囲の人間に理解されていないと大変というか普通に仕事は出来ないけど出社しているわけですから、職場の環境にもよると思います。

「転勤や妊娠になったら会社に迷惑がかかる」ということですが、実際にその状況になってから考えればいいと思います。いつ彼が転勤になるか分からないということですが、実際にすぐ転勤すると決まっている訳ではないですし、近くのエリアに異動ということも考えられますよね・・？彼のお仕事がどういう転勤事情かは分かりませんが、「たら・れば」という仮定の話で動くのは無意味かと思います。

また、妊娠も同様です。必ずしもすぐに妊娠→出産できるとは限りません。もしかしたら不妊治療を必要とするケースもあるかもしれませんし、出産をあきらめて夫婦で生きていく選択になる可能性もあります。先が見えないことですので、治療などいざという時に必要となるお金や、将来の安定した生活のために、正社員になって今以上の収入を得られる状態にしておくことはとても重要なことだと思います。

いざ、転勤・出産ということになれば、会社は辞めればいいと思います。（人にもよりますが）仕事は生活のために稼ぐことが目的でしていると思います。確かに会社には多少なりとも迷惑は掛かりますが、優先すべきは「自分の生活」「プライベート」です。実際に、新卒から入社して働いている女性社員であっても、旦那さんの転勤や妊娠により周囲からは迷惑と思われてしまうような辞め方をせざる負えない方は沢山います。一度辞めたらその会社との関わりはなくなると言っても過言ではないので、会社に気を使う必要はありません。

あゆみさんが直接雇用を希望していないのであれば別ですが、将来の「もし～」のために二の足を踏む必要はないと思います。