結納について

お気持ちはとても分かります。
でも、相手の希望で順序が…とはいえ、最終的にはなっチャンさんもこのタイミングがベストだと思って入籍されたわけでしょう？
その点に不満を持つのはやめましょう･･･。

さて、「今、どうしたらいいのでしょう？」とおっしゃっていますが、
具体的に何をしたい（してほしい）のでしょう？

結納をしなかったことを後悔されているようですが、その理由は何でしょう？
きちんと挨拶をして欲しかった？
きちんと結納金を欲しかった？

それがハッキリすれば、今更結納をしなくとも、納得のいく結果が得られると思いますよ。

PS
ただ、ご相談を拝見し、
彼に貯金がなく、家具家電は実質自分が揃えた。50万のお祝い金をくれると言うが、これでは結婚式には足りない！と文句を言っているように感じてしましました・・・。
50万のお祝い金をいただけるだけでも十分だと思いますよ。

すみません。辛口になってしまいますが・・・

①相談者さんご自身が彼に貯金がないことが嫌なのか
②ご自身のご両親の大切な娘への気持ちを考えて、親に申し訳ないと思っているのか
③相手の親が結納をしてくれないことが不満なのか

相談文から上記のどれなのかがわかりません。全てかもしれませんが・・・。
①彼に貯貯金ができらから結婚すればよかったのでは？
　結婚を決めたのはご自身ですから自己責任だと思います。
②大切な娘さんですから、ご両親のお気持ちはよくわかります。
　私だったら結納はしてもらえないけどお祝い金をもらったし
　彼のご両親にこんな言葉をかけてもらったよとか
　相手の親は自分でやりなさいという考えだから、彼がしっかりしていて頼りになるとか
　自分の親に話して安心させます。
③結婚って、独立して自分達で家庭を築くってことですよね？
　そう考えれば自分たちで何とかしなさいとおっしゃっている
　旦那さまのご両親の考え方もわかります。お祝い金だけで十分ではないですか？
　貯金のない息子の責任を結納と言う形で相手の親にとってほしいのでしょうか？　
　大げさかもしれませんが、旦那様のご両親がいなければ
　旦那様はこの世に存在せず、出会って結婚することもなかったのです
　旦那さまを産み、育ててくださったご両親に感謝するくらいのお気持で
　いた方がいいと思います。
　
私たちはお互いの実家も色々な事情があり、結納も援助もないですが
お互いの親をそれぞれではなく二人で一緒に大事にしています。
彼のご両親も私のことを本当に可愛がってくれて
私の両親も彼をとても可愛がっています。
私は結婚することになり家族が増えるって幸せを感じています。
私の考えが正しいとは思いません。
結納くらいしてもらうのが当たり前なのかもしれません。
けど、ご自身の考えを変えるだけで
ご自身が今よりもっと幸せになれるのではないかなと思いました。